Il est recommandé d'être à jeun si une solution de contraste est administrée par voie orale ou rectale "mais en général, il ne faut pas interrompre son traitement en cours et bien prendre ses comprimés habituels le matin de l'examen", relève le Pr Vincent Vidal, spécialiste de radiologie interventionnelle à l'hôpital de la Timone à Marseille – AP-HM. Toutes allergies à l'iode doit être signalée aux professionnels de santé. La prise d'un médicament anti-allergique peut être envisagée.
Le scanner n'est pas indiqué pour les femmes enceintes : les rayons X peuvent être dangereux pour le fœtus. Il faut également vérifier l'absence d'insuffisance rénale ainsi que les médicaments pris par le malade, notamment certains antidiabétiques oraux qui devront être arrêtés pendant une courte période après le scanner.